邱宝仁，福建闽侯人，1867年考入福州船政学堂第一期，学习航海驾驶。1871年，上“建威”练船实习，历经南洋新加坡、槟榔屿，以及渤海湾、辽东半岛各口岸。1875年，复上“扬武”舰练习，航行外海，南历新加坡、小吕宋、槟榔屿各口岸，北至日本而还。1879年，清政府从英国订购的“镇”字号四艘炮舰回国，邱宝仁升守备，管带“镇东”炮舰。1880年8月，“镇东”等四炮舰出游黄海，至海洋岛，“镇南”不慎触礁，旋即脱险。邱宝仁因“救援不力”，被“撤革摘顶，以示惩戒”。

　　1887年，在英德订造的“致远”、“靖远”、“经远”、“来远”四舰竣工，李鸿章奏派邱宝仁和邓世昌、叶祖珪、林永升出洋接带。1888年，四舰安抵大沽。这次接舰回国，皆由中国将领管带，“不另保险，省费数十万”，“即无雇募资遣之烦，复得沿途练习之益”。邱宝仁以“远涉重洋数万里，驾驶回国，均极辛劳”，被赏劲勇巴图鲁勇号。1889年，升署右翼左营副将，委带“来远”舰。1892年4月，以3年署理期满，改为实授。

　　1894年9月17日，黄海大战爆发。海战中，邱宝仁与“来远”全舰官兵拼死作战，遂受重伤。“来远舱内中弹过多，延烧房舱数十间”，顿时“烈焰腾空，被猛火包围，但舰首炮依然发射，士卒奋力救火。此时，机器室内火焰升腾，不得已将通风管密闭，黑暗中由上甲板向焚火室传达命令仅靠通风管传话。全舰官兵不顾200度之高温，始终坚守岗位，恪尽职守”。邱宝仁指挥全舰官兵一面抗敌，一面救火，终于将火扑灭，继续与敌博战。海战结束，“来远驶回旅顺之际，中西各人见其伤势沉重，而竟安然返旆，无不大奇之”。

　　1895年2月6日晨4时，日本鱼雷艇进威海卫港偷袭，“来远”中雷，舰身倾覆，邱宝仁被水手救上刘公岛。北洋水师覆没后，被革职。